所谓粪菌移植，简单来说是从健康人的粪便中提取功能性菌群，然后移植到患者的肠道内，通过重建患者新的肠道菌群，从而达到肠内外疾病治疗的目的。其实有关粪菌移植最早的记录在公元300-400年，我们的祖先东汉时期葛洪在有关的医学书籍里面有记载，通过用人的粪上清来治疗食物中毒以及严重腹泻，都取得比较好的效果。西方国家在1958年的时候，美国的一个外科医生通过用粪菌移植的方法治疗伪膜性肠炎，也取得比较好的疗效。随着时代的发展，粪菌移植的方法学也在不断的演变，从最原始的手工制作方法到现代智能化的机器分离，即现在标准化的粪菌移植。所谓标准化粪菌移植是借助现代的实验室仪器，把健康人粪便中的菌群进行高度纯化分离，然后通过移植到患者肠道内。标准化粪菌分离对硬件以及软件要求都比较高。首先要有独立粪菌分离实验室，并且要经过培训熟练、经验丰富的操作技术人员，其次要有一套比较完整的、严格的供体筛查体系。