脑袋两边疼的原因多种多样，主要如下：1、高血压病：血压的收缩压大于140mmHg，舒张压大于90mmHg，有的患者就会出现头部两边疼痛；2、脑内出血：如蛛网膜下腔出血、脑出血；3、脑部肿瘤：如胶质瘤、脑膜癌病等；4、偏头痛或紧张性头痛：也可以出现脑袋两侧的疼痛；5、颅内感染：如化脓性脑炎、结核型脑炎以及病毒性脑炎，或者炎性的脱髓鞘病变，如多发性硬化，也可以出现头痛的症状；6、青光眼或者鼻窦炎：也可以出现脑袋两边疼痛。