对于葡萄球菌感染首选的药物，要结合患者感染的部位分析。不同感染部位，药物的浓度有所区别，首选的药物也会存在差异。具体如下：一、社区或院内感染：1、社区感染：葡萄球菌的感染如果是社区获得，病情相对比较轻，有可能不是耐药的细菌感染。此时可以首选头孢唑林，也可以选择苯唑西林；2、院内感染：如果患者是院内感染，尤其病情比较重，此时可能就要选择针对耐药的葡萄球菌感染，首选万古霉素、替考拉宁、利奈唑胺或者是达托霉素，一般会首选万古霉素。对于患者如果有肾功能不全的情况下，可以考虑应用利奈唑胺或者应用替考拉宁，对于患者如果皮肤软组织感染非常严重，也可以选用达托霉素。二、感染部位：不同部位感染选择的抗菌药物也有所区别，具体如下：1、血流感染：一般如果是考虑败血症，是血流的感染，一般不会选择利奈唑胺。因为利奈唑胺对于血流的感染浓度相对不是很高，一般首选万古霉素；2、中枢神经系统感染：但如果是中枢神经系统的感染，替考拉宁一般不能够透过血-脑屏障，所以一般不会选择替考拉宁治疗中枢神经系统的感染；3、肺部感染：如是葡萄球菌引起的肺部的感染，此时不能够选择达托霉素。因为达托霉素在肺中，肺表面的活性物质会对于达托霉素进行灭活，就不会发挥抗感染的作用。