紧急避孕药的代谢时间在3天左右，具体代谢时间取决于紧急避孕药的种类，常用的避孕药物包括孕激素、前列腺激素以及雌激素、孕激素混合剂型等，具体如下：1、单剂量高效价孕激素：以左炔诺孕酮为代表，服用以后一般在3-7天完全代谢干净；2、前列腺激素：如米非司酮类药物，代谢较快，一般在24-72小时内代谢完全；3、雌孕激素混合制剂：在3-7天代谢完全。紧急避孕药主要通过干扰受精卵着床或改变宫颈黏液性质，影响精子进入或改变卵巢排卵情况，干扰排卵，达到避孕目的。激素类药物可能会改变内分泌环境并影响排卵，特别是孕激素和雌激素药物，不能作为常规避孕方式，只是避孕失败的补救手段。