早上起来口苦原因有以下几种：1、胃肠道动力障碍：如患有糖尿病或脑血管疾病，整个胃肠道出现动力障碍，此时患者早起后会有口苦的情况；2、胃肠道菌群失调：如患者如果有长期便秘或糖尿病等慢性病，很容易引起肠道内菌群失调，有可能表现为口苦；3、幽门螺杆菌感染：中国的感染率较高，大概有30%-40%的人群出现幽门螺杆菌感染而表现为口苦；4、口腔感染或溃疡：如果有牙龈炎、牙周炎，此时早起时也会表现为口苦；5、糖尿病：如果患有常见的内分泌疾病即糖尿病，糖尿病病人早起后可能就会觉得口干、口苦、缺水。