小腿酸疼的原因如下：1、无菌性炎症：小腿肌肉过度的疲劳，部分人群可能长期不运动，最近突然旅游、爬山，导致小腿肌肉出现过度疲劳，引起无菌性炎症，导致小腿酸疼；2、软组织损伤：可能是运动过程中造成小腿肌肉出现撕裂、损伤，从而导致局部小腿疼痛、酸疼；3、神经受压：腰椎间盘突出，支配小腿的神经受到压迫后会导致小腿酸疼、麻木；4、膝关节病变：膝关节严重的骨关节病、腘窝囊肿可能引起小腿酸疼；5、小腿本身病变：小腿本身的肌肉、软组织、骨性结构病变，比如小腿肌肉内长了肿瘤、囊肿等，有可能是小腿骨头内原发性转移性的骨肿瘤、骨髓炎等，也容易引起小腿酸疼。