花斑癣根治首选抗真菌药物，可以控制皮肤表面寄生的马拉色菌，比如外用的抗真菌药物，如联苯苄唑乳膏、酮康唑乳膏、盐酸特比萘芬乳膏，外用治疗花斑癣均比较有效。顽固的花斑癣还可以考虑口服抗真菌药物，比如伊曲康唑。在使用药物治疗的同时还要加强皮肤的清洁卫生，以减少花斑癣菌的再感染或复发。马拉色菌是人体皮肤表面正常的寄居菌，并不致病，只有在某些条件下才会由孢子相转变为菌丝相，导致皮肤花斑癣的症状。引起马拉色菌致病的条件，一方面可能与外界环境、气候有关，比如高温、潮湿的环境，这时马拉色菌容易过度繁殖，另一方面是皮肤表面汗或油脂过多，马拉色菌也容易繁殖。所以一定要加强皮肤的清洁卫生，祛除皮肤上过多的油脂、污垢等，才有利于花斑癣的控制。有些人花斑癣反复发作可能是基础疾病，导致机体的免疫功能下降所引起，想要根治便要积极控制基础疾病，比如糖尿病等，才可能根治花斑癣。