菌血症的治疗时间要具体情况具体分析，具体如下：1、一过性菌血症：短时间出现，可能治疗2-3天就可痊愈；2、肺脓肿或肝脓肿：体内的病灶可能定期或不定期地释放细菌入血，此时治疗时间有可能很长，1-3个星期甚至更久都有可能。在治疗上不仅需要使用抗菌素将血液内细菌杀灭，还需治疗脓肿，才能将菌血症彻底解决，总疗程有可能1个月甚至更久；3、耐药菌：细菌难治如耐药菌对常见的抗生素效果不好，可能需中间调整抗生素为更高级别的抗生素，此时病人的病程会延长。所以菌血症个人的治疗疗程可能不同，一定要在专业医生的指导下规范治疗。