飞秒视力矫正术不疼，包括飞秒激光在内，所有矫正激光手术在手术前，都会点用表皮麻药，从而使眼表处于麻醉状态。这样可以保证患者在手术过程中，不会感到任何疼痛，从而使患者更能配合手术操作。飞秒激光手术中，因为使用的是高能量、高聚焦、切削精准的飞秒激光，所以通常术后恢复期会有更好的恢复效果。使用飞秒激光可以减少术后恢复时间，使患者获得更好的康复。对于飞秒激光手术而言，手术后麻药停止作用时，可能会有轻微的眼部不适，如眼部痛、异物感，通常2-3天或1周左右即可消失。角膜激光手术较为安全、无痛苦，飞秒激光更是如此。即使术后可能有轻微不适，但通过使用含人工泪液、激素的眼药水，都可以使症状得到明显改善、缓解。