引起喉咙吞咽刺痛的原因较多，具体如下：1、咽喉炎症：如扁桃体炎、急性咽喉炎，以及会厌炎等。当炎症较明显时，吞咽疼痛可加剧；2、咽喉溃疡：尤其在扁桃体形成溃疡，或咽侧壁等部位，有溃疡时做吞咽运动，可引起明显刺痛；3、咽喉异物：尤其吃鱼，或带有刺的骨头后等，均可引起吞咽时刺痛明显；4、茎突过长：茎突过长也可导致吞咽时有刺痛感，且可能向耳部放射。当喉咙吞咽有刺痛感时，一定要到医院就诊，通过咽喉镜的检查、影像学的检查，及时发现病因，进行治疗。