睡觉喉咙发痒、咳嗽的原因如下：1、外界刺激：临床上很多病人主诉在睡觉的时候咽喉发痒，引起咳嗽。其原因是在入睡后会张口呼吸，外界刺激就会引起喉咙发痒，出现反应性咳嗽即刺激性咳嗽，这是临床常见的原因；2、过敏：部分病人睡觉时咳嗽，通常是夜间咳嗽，可能与过敏疾病相关。如支气管哮喘、过敏性鼻炎病人，会出现夜间咳嗽症状，会影响睡眠；3、非呼吸系统疾病：如胃是食管反流病，除咳嗽外，还有烧心、反酸、嗳气等消化系统症状。发生上述症状的同时，可伴有夜间咳嗽，是胃食管反流病的特征性表现；4、咳嗽变异性哮喘：是哮喘的特殊类型，咳嗽是唯一症状，往往因夜间咳嗽而引起哮喘；5、睡眠呼吸暂停综合征：表现为夜间打呼噜时张口呼吸明显，所以睡眠呼吸暂停征患者多数伴有咽炎，而咽炎最重要的特点就是夜间咳嗽。