在临床上，卵巢囊肿需要常规做肿瘤标志物检查，CA125是肿瘤标志物之一，CA125偏高并不能完全确定，卵巢囊肿的性质，只能提供一种参考。CA125是临床上鉴别卵巢良恶性肿瘤的手段，CA125升高在多数的卵巢的上皮性癌症中，发生率较高，大约80%的上皮性卵巢癌伴随CA125的升高，升高程度与病变程度有关。如果CA125升高较明显，提示癌症情况较严重，CA125还可以作为卵巢癌手术以后的监测手段。如果在术后，CA125转阴又复阳，考虑卵巢肿物，有复发的倾向。对于卵巢囊肿CA125稍高，并不能够确定肿物一定为恶性。在临床上，还有一些良性的情况，也会引起CA125的增高，常见的是子宫内膜异位症、子宫腺肌症等。