早上起来眼睛肿，主要有以下几方面原因：1、生理性因素：生理性的眼睛肿，是因为眼睑的皮下组织特别疏松，容易潴留水分。如果晚上睡觉头脚等高，部分水分由于血压的影响，会在眼睑的皮下组织潴留。夜间摄入较多的水或者盐，也会导致水分潴留。另外女性在月经前期，由于雌激素分泌增多，也会导致眼睑皮下水分潴留。生理性因素引起的眼睛肿，通过冷敷、休息，就可以恢复正常；2、病理性因素：病理性因素引起的眼睛肿，通常不容易恢复，会持续存在。通常是由于机体出现肾病或者心脏病，但具体的疾病类型还是应该到医院进行相关检查，再进行确诊、治疗。