新生儿先天性心脏病的检查通常分为初步筛查、辅助检查等，具体如下：1、初步筛查：出生前可通过B超，进行初步的先天性心脏病筛查。出生后儿科医生进行例行体检，通过听诊器进行杂音检测，同时观察是否存在缺氧问题，可采用监测血氧浓度的方法进行；2、辅助检查：如果经过上述检查，高度怀疑存在先心病，可以进一步进行超声心动图的检查，明确观察心脏结构。先天性心脏病病情较为严重，出生后能够明显的发现孩子存在缺氧，或者由于喂养不当出现呛奶等情况，如果症状不典型时，需借助相关检查完成。