阴茎根部三角区右侧疼痛，可能是因为前列腺炎，或者是右侧精索静脉曲张、右侧阴茎根部毛囊发炎等原因所致，出现这种情况，要到医院的泌尿外科或者男科就诊，可以明确病因。1、前列腺炎：除阴茎根部疼痛外，还会有尿频、尿急、排尿灼热感，排尿、排便后尿道口有分泌液流出，也可能会出现射精疼痛等，这种情况做前列腺液检查可以诊断清楚；2、右侧精索静脉曲张：这种疼痛主要表现在站立时、大量运动后加重，平卧位后会缓解，做阴囊彩超可以评估清楚，曲张程度重建议手术治疗；3、右侧阴茎根部毛囊发炎：如果发现阴茎根部毛囊发炎，局部会有发红、肿胀、疼痛等症状，此时如果炎症比较轻，建议口服广谱抗菌素，如果炎症比较重，已经形成化脓性改变，就要进行手术切除。