儿童应用眼药水主要是根据病因来进行应用，主要病因不同，选择的眼药水也各有不同，具体如下：1、病毒感染：如果儿童得了红眼病，也就是一种病毒感染的时候，这个时候可以采用更昔洛韦的眼药水；2、细菌感染：如果儿童眼部的分泌物非常多，呈黄脓性，考虑是细菌感染，可以应用抗菌素的眼药水，比如对于儿童比较常用的是妥布霉素的眼药水或者是红霉素的眼膏。这两种抗菌素都是大环内酯类的药物，对儿童相对比较安全。而如果是喹诺酮类的眼药水或者是氯霉素眼药水，这两种抗菌素对于儿童相对不安全，不建议应用；3、免疫性疾病：有些儿童是由于一些免疫性疾病所导致的眼部病变，这个时候要用激素类的眼药水。