肺部活检一般是经过穿刺针，就是CT引导下穿刺或者B超引导下穿刺，或者经支气管镜的穿刺。还有进行外科的肺活检，比如胸腔镜下或者开胸的肺活检，直接手术切除一小部分肺进行活检。创伤比较小的就是CT引导下或者B超引导下的穿刺，就是经皮肤扎针进去，取少部分的肺组织来进行活检，进行病理检查。如果病变靠近支气管，就是中央的大气道的情况下，可以经过支气管镜进行穿刺活检。如果病变在支气管黏膜上，可以进行支气管黏膜的活检，用一个钳子取一小部分肺组织，或者穿刺针这种穿刺活检。如果纵膈里有比较大的淋巴结，可以透过支气管壁来穿刺淋巴结进行活检。如果管腔里没有靠近中央的大的团块、靠近支气管的团块，经过透壁可以进行团块的活检。所以这是两种相对创伤比较小的检查，若不容易做、不容易实现，或者活检以后没有取到理想的病灶。有的时候病灶比较小，CT引导也不是直视下看的活检，或者病变组织比较小，取不到需要的病灶组织，要再进行外科的肺活检，就是在胸腔镜下取。​如果胸腔镜下看见有一部分肺组织颜色不一样，或者是肿胀，或者有个团块，可以在胸腔镜下取或者直接开胸取肺组织。