头痛、腹泻，主要可能是以下疾病：1、急性感染性疾病：头痛和腹泻如果同时发生，在急性期通常属于急性感染性疾病，并且很多患者都经历过这样的临床过程，突然开始腹泻，并且同时伴有头痛。患者此时要迅速测量体温，明确是否出现发热，如果发热、腹泻、头痛同时出现，建议患者尽快到专业的医院通过专业的门诊，得到正规的诊断和治疗；2、慢性疾病：另外部分患者出现的腹泻、头痛属于慢性的过程，即反复出现头痛、腹泻；3、功能性疾病：比如部分患者的腹泻，属于排便习惯改变，通常与自身的情绪相关，比如很多患者因为焦虑、紧张，从而导致头痛，头痛之后又出现消化道的症状，比如腹痛和腹泻，并且为反复多次出现。尤其到医院反复就诊排除器质性疾病的患者，需要考虑为功能性问题所致，有时患者就需要在医院得到治疗，或者部分患者需要调节自己的身心，达到逐渐恢复正常的状态。