正常的育龄期妇女体内有一定的雌激素水平，这些雌激素可以使阴道上皮增生，使上皮细胞内所含的糖原增加。糖原在阴道乳杆菌的作用下可以分解为乳酸，使阴道呈现弱酸性的环境，一般pH值应该是≤4.5。弱酸性环境可以抑制大多数的细菌的生长，称为阴道的自净作用。 但是对于绝经以后的妇女，由于卵巢功能低下，卵巢功能的衰竭，体内的雌激素水平明显下降，没有雌激素作用，使阴道的上皮萎缩变薄。上皮里所含的糖原减少，在乳杆菌的作用下形成的乳酸明显减少，使阴道的pH值就增高，不能保持一个阴道的自净作用。在这种情况下，阴道如果有外来细菌的感染，或者是自身菌群的紊乱都可以造成老年性阴道炎。所以老年性阴道炎主要的发病原因还是体内雌激素水平下降，阴道自净作用减弱以后造成。