胆总管结石的症状主要是结石堵塞胆管，而引起腹痛、黄疸、寒战、发热，以及伴随胆汁排出不畅，而导致消化不良、腹胀、厌油腻、恶心、乏力等。腹痛、寒战、发热、黄疸是急性梗阻性化脓性胆管炎的典型表现，多数是胆管结石引起，结石堵塞胆道，胆汁无法正常进入肠道继而反流，胆道内压力升高，合并细菌感染，会出现典型的三联征。如果感染未及时控制，继而发展成为感染中毒性休克，患者除明显的腹痛、发热、黄疸之外，还有可能会出现少尿、神志淡漠、血压下降、四肢皮肤湿冷等感染中毒性休克的表现，若不及时治疗则有生命危险。如果胆管内结石未完全堵塞胆管，但是胆汁排出不畅，在进食时，患者会出现腹胀、消化不良、上腹部隐隐不适。胆汁长时间影响脂肪的消化吸收，患者容易出现营养不良、体重下降等，长期的胆管结石刺激胆管壁，也会增加胆管癌变的风险。