3岁宝宝夜间咳嗽的原因较多，具体如下：1、呼吸道感染：较常见，3岁左右的儿童呼吸道还未发育完善，外界病毒、细菌、支原体、衣原体感染均可能造成夜间咳嗽。临床需针对原发疾病，进行抗炎治疗和对症止咳治疗，可有效缓解相关症状；2、特殊感染：比如结核感染等，也容易出现夜间咳嗽，同时可能伴有低热、盗汗等，需及时进行结核检测，同时进行抗结核治疗。百日咳等少见疾病会出现夜间咳嗽加重的现象，需通过对症治疗缓解症状；3、非感染性因素：比如哮喘、过敏性咳嗽、胃食管反流等，胃食管反流者在夜间平卧时可能会加重咳嗽症状。哮喘、过敏性咳嗽容易在夜间发作，相对而言白天症状较轻，临床需进行过敏检测后予以对症的抗过敏治疗。因此，儿童夜间咳嗽需进行鉴别诊断，不同病因的对症治疗方法差异性较大。