肛周脓肿在急性感染期时感染组织会出现红肿肿块，肛周脓肿是一种只有通过手术才能够治愈疾病，手术治愈此类疾病唯一一个方法。因此出现肛周脓肿如果诊断较明确时，应该及时选择手术治疗，手术目的是将脓肿脓腔切开，使脓液充分顺利地引流出，脓肿切开排脓后，后期往往会变成肛瘘，需要进行第二次手术才能够完全治愈。 如果条件允许可以一次性进行根治术，因为肛周脓肿不治疗还会向周围其它间隙蔓延，导致脓肿病变扩大，有可能发生坏死性筋膜炎，甚至还可能危及生命。如果时间或条件不允许或有其他病情影响无法手术，可以在这时使用抗菌药物等方法保守治疗，通过消炎脓液慢慢可以吸收，一般1周左右局部红肿会慢慢消退，但最后肿块并不会完全消退，脓肿会形成一个硬结，脓腔疤痕组织会形成一个条索状管道，因为感染根源是因为内口存在，后期可能反复出现急性感染引发肛周脓肿的症状。总之保守治疗无法治愈肛周脓肿，最后还需要进行手术治疗。