月经干净后第3天同房有一定几率发生怀孕，怀孕主要是需要有女性排卵，排卵发生在排卵期，排卵期位于两次月经之间，下次月经来潮之前的14天左右，在排卵日期的前后5天可能会怀孕，即易孕期，除这段时间以外称为安全期。安全期避孕方法，并不能达到100%避孕有效率，所以有些女性使用安全期避孕法会发生意外妊娠。月经干净的第3天，需要看平时月经周期多久，如果月经周期本来就比较长，月经干净第3天离排卵期还有一段时间，这时同房可能不会怀孕，但如果本来月经周期比较短，20多天来一次，每次月经如果能来7天，月经干净第3天已经是月经期的第10天，基本已经处于排卵前后，这10天之内就容易发生怀孕。所以女性最好采取更加可靠、确切的避孕措施，尽量不要采取安全期避孕法来避孕。