生化妊娠一般都会有阴道出血。临床典型症状是月经推迟几天后出现阴道出血，阴道出血量一般比平素月经量要略微多一些，辅助检查会发现阴道出血之前有血尿HCG升高阳性或者弱阳，阴道出血之后转为阴性，而B超检查没有看到宫内孕囊，这种称为生化妊娠，是最早期的流产。生化妊娠一般与胚胎发育异常相关，比如胚胎染色体异常，有时就会出现生化妊娠，属于自然界的优胜劣汰。生化妊娠如果不做B超、血尿HCG，常常会判断为月经来潮，或者比正常月经来潮经量要略微多，有时候不会判断为生化妊娠。​只有检查了血尿HCG，发现血尿HCG由阳性转为阴性，而且B超没有看到宫内孕囊，这时才能够明确诊断生化妊娠。常常自然界中，一些月经量稍多的经血，实际是生化妊娠的表现。