骶管囊肿手术多数是微创。多数骶管囊肿患者，无需进行手术处理。如果骶管囊肿刺激压迫马尾神经引起症状，则可以采用微创手术的方法，将囊肿液抽出，采用生物蛋白胶封闭进行治疗。但是对于较巨大的骶管囊肿，也可能采用开放手术，但此种情况极为少见。骶管囊肿是尾椎椎管里所产生的一种良性病变，通常患者是在体检中无意发现，或者怀疑有腰椎间盘突出时，检查腰椎核磁共振，无意间发现有骶管囊肿。此时较多患者就非常紧张，怀疑囊肿是否需要处理或是否会恶化。​多数情况下，骶管囊肿患者无需进行手术治疗，也不会恶化，一般不会引起症状。只有骶管囊肿特别大，刺激和压迫马尾神经，甚至造成骶管周围的骨质破坏和侵蚀时，才需进行手术处理。如果骶管囊肿需做手术，优先考虑微创手术。通常在患者背部在CT检查的引导下，采用特殊穿刺针进行穿刺，穿刺针到达囊肿区域，将囊肿区域液体抽出，采用生物蛋白胶对囊肿区域进行封闭，从而实现微创手术，解决骶管囊肿的问题。对于较巨大的囊肿，也可以采用开放手术治疗，但多数骶管囊肿不需要手术，即便是手术，也首选微创手术。