妇科做支原体和衣原体检查，主要目的是检查是否有这两种介于病毒和细菌之间的微小生物感染，具体治疗如下：1、支原体感染：如果检查为阳性结果，临床没有症状，可以不用治疗。因为支原体属于条件致病菌，在没有症状的情况下也不会造成传染，所以不需要治疗。但是要加强外阴局部护理，注意性生活的卫生。而支原体感染出现临床症状，可以用阿奇霉素进行治疗，治疗期间不可以有性生活；2、衣原体感染：衣原体感染通常通过性接触传染，所以在临床上需要积极治疗。衣原体感染通常会引起分泌物增多、尿频、尿急、尿痛等，首选阿奇霉素进行治疗。如果阿奇霉素过敏，也可以选择强力霉素(多西环素)治疗，都会达到比较好的治疗效果。在临床症状消失之后，可以复查衣原体是否出现阳性结果。如果一旦出现阳性结果，可以继续用药治疗，直到转为阴性为止。