男性阴茎根部瘙痒，应及时到皮肤性病科就医，常见原因如下：1、真菌感染：可能由于感染白色念珠菌所致，当患者患阴茎、龟头或包皮炎症时，可以使阴茎根部真菌感染，表现为局部瘙痒、渗液改变；2、湿疹：病人阴茎根部出现湿疹时，会引起皮肤集簇样水泡改变，伴局部渗液和局部瘙痒症状；3、阴虱：常寄生于阴阜、阴毛内，导致阴茎根部出现瘙痒症状，且夜间症状明显。同时病人体检时，会发现阴茎根部皮肤出现蓝紫色改变；4、疥虫感染：病人患疥虫感染时，会引起疥疮结节，使阴茎根部皮肤出现多发疥疮结节改变，伴奇痒难忍症状。同时手指缝和大腿内侧也会出现疥疮结节，表现为局部瘙痒症状。