小孩的阴茎太小，通常要针对病因进行治疗。引起儿童小阴茎的原因，要注意鉴别。具体如下：1、肥胖：如果小孩肥胖，会导致隐匿性阴茎，阴茎会藏在脂肪内，会显示阴茎偏小，通常通过减肥以后就能够改善；2、下丘脑和垂体疾病：注意是否为下丘脑和垂体有疾病，下丘脑和垂体的疾病，通常会导致分泌的促性腺激素发育分泌异常，导致阴茎短小，要针对下丘脑和垂体的疾病来进行治疗；3、睾丸发育不全：如果小孩的睾丸存在着发育不全，会引起雄性激素分泌减少，也会导致阴茎过小，也要针对性的给予、应用雄性激素进行治疗。大多数引起小阴茎的原因，是由上面因素引起的；4、染色体问题：部分小孩是由于染色体或者基因问题导致，常常要完善小孩的染色体检查来确诊，所以这种小孩应当及时到内分泌科就诊。要给小孩完善相关的性腺激素水平测定，必要时可以用促性腺激素释放激素等实验来进行测定，小孩到底是哪一方面的问题，还可以做垂体和下丘脑核磁共振，做小孩睾丸彩超等来明确，必要时要做染色体检查来明确。可以给小孩应用性腺激素和促性腺激素释放的办法，来促进阴茎长大。如果对于药物治疗效果不好，还可以进行手术治疗。只有经过适当治疗以后，才不影响小孩将来的性功能，不影响小孩的生育能力。