鼻内窥镜检查在进行操作前需进行鼻腔的表面麻醉，表面麻醉后，对于较表浅的腔，如上颌窦，多数患者可进行简单的检查。但进行鼻内镜检查的患者往往会有较严重的鼻窦炎，且黏膜肥厚，窦口可能阻塞，若需对各个窦进行检查或处理，应进行全身麻醉。 因为单凭静脉麻醉无法进行窦口开放、黏膜切除等操作，因此经常内窥镜检查与手术操作同时进行。此外，即使进行全身麻醉，也会在手术开始前使用局麻药，使鼻腔黏膜麻醉和收缩，以减少手术出血及术后疼痛。