脑门中间痛，没有一定的特异性和指向性。可能是脑内的器质性疾病引起，如脑出血、蛛网膜下腔出血、脑膜癌病、颅内肿瘤，还包括颅内炎症，如脑膜脑炎等，都可能表现为脑门中间痛。通常上述器质性疾病会伴有恶心、呕吐，而颅内感染的患者可能有前驱感染史或免疫低下史，或有发热表现，查体时可能还会出现脑膜刺激征阳性和脑实质损害表现。若是脑内没有发现病因但出现了脑门中间痛，还常见于紧张性头痛、丛集性头痛、偏头痛，还有鼻窦部炎症。对于不同病因的头痛，需根据其自身特点进行仔细鉴别诊断。