结膜炎久治不愈，主要是有两大原因：1、病因去除不彻底：结膜炎主要包括感染性和非感染性两大原因，感染性因素包括细菌、病毒、真菌、阿米巴、衣原体，此类微生物感染引起结膜炎。使用相应的眼药水，包括抗菌素眼药水、抗病毒眼药水、抗真菌眼药水，均完全不同；2、治疗过程不充分及治疗方案不妥当：结膜炎在临床处理过程中，在不同时间段会使用不同的抗菌素眼药水，眼药水使用的频次及配伍的用药也会发生改变。联合使用非甾体类消炎药、人工泪液、眼表修复剂，在使用频次及种类的更换上，在不同阶段均需要不同的替换，以达到最终结膜炎的根治。结膜炎久治不愈，最主要的原因还在于病因处理不到位。只要病因去除彻底，结膜炎必定会达到临床治愈。