早晨起床眼睛有眼屎，主要见于以下几种情况：1、结膜炎：眼睛有大量黏性分泌物，且分泌物颜色较黄，属于球结膜的急性炎症。经过晚上休息后，由于闭着眼睛，睫毛囊的温度较高，大量细菌在睫毛囊内繁殖。此时可以通过就医，选择敏感性抗生素，予以频繁滴眼缓解炎症表现。经过一段时间的频繁滴眼治疗后，结膜炎症状可逐渐好转；2、干眼症：眼睛分泌物较少，表现为白色、较硬的小颗粒，在眼睛的内眦或者外眦附着。此时眼睛较干，甚至泪液较少，眼睛内分泌的黏液较少；3、药物反应：部分患者知道眼睛出现干眼症，晚上为保护角膜，滴入保护角膜剂。保护角膜剂性质较黏稠，可在结膜囊内表现出有黏性凝固现象，类似眼屎，此时需区别对待。