HPV疫苗需要6个月打完，6个月之内有怀孕计划的人群不建议注射，6个月之后才有怀孕计划则可以注射。WHO的立场文件表示，备孕期间注射HPV疫苗对怀孕及免疫系统没有明显影响，若马上就有怀孕计划，可以等哺乳期过再接种HPV疫苗，但半年以上才准备怀孕的人，可先接种HPV疫苗。如果在接种疫苗期间意外怀孕，也可以继续妊娠，只需要做好产检，不必因为接种HPV疫苗做流产手术。HPV疫苗总体而言比较安全，2017年WHO发布了关于HPV疫苗的立场文件，主要讲解宫颈癌疫苗的安全性，其副作用主要是局部注射部位的结节、疼痛，部分人会出现低热，但以上症状通常24-48小时可自行消退，多数不发生很严重的反应。