在不同医院对于免疫五项所代表的具体指标不一样，比如部分医院没有免疫五项检查方法，对于免疫功能的评价往往会检测患者的T细胞亚群水平，检测相关自身抗体和免疫球蛋白水平。在T细胞亚群里，主要关注患者的CD4细胞水平。当患者CD4细胞水平显著降低时，代表患者的免疫功能受损，在免疫球蛋白里包括IgG、IgM、IgA等指标，在某些自身免疫性肝脏疾病，比如自身免疫性肝炎里，IgG是升高的；在原发性胆汁性胆管炎里面的IgM是升高的。所以有肝病的患者出现IgG和IgM升高，同时肝病的原因不清楚时，一定要小心有没有合并自身免疫性肝炎和原发性胆汁性胆管炎的情况。 免疫相关指标有些相关的自身抗体，其中抗线粒体抗体，特别是M2亚型抗体往往提示是原发性胆汁性胆管炎。如果是抗平滑肌抗体等，往往是自身免疫性肝炎情况，所以要根据免疫五项的具体指标决定。