扁桃体疼最常见的原因主要有病毒感染、细菌感染，治疗方法具体如下：1、病毒感染：病毒感染最常见于上呼吸道的病毒感染性炎症，比如感冒。每次感冒发作，都会有一次咽部黏膜的急性炎症，有时可能会并发急性的扁桃体炎。此时除了用感冒药以外，可以多喝水，注意休息，避免进食辛辣、刺激的食物，一般都可以愈合，病毒感染有自限性；2、细菌感染：若是细菌感染性的扁桃体炎，此时一般要用抗生素，可以是口服抗生素，也可以静脉给予抗生素。在抗生素的种类方面，可以是青霉素类的抗生素，如阿莫西林、阿莫西林克拉维酸钾、氟氯西林、哌拉西林等。也可以用头孢类的抗生素，如一代头孢、二代头孢，比如头孢氨苄、头孢克洛、头孢呋辛、头孢丙烯等。此外，成年患者在非孕期、非哺乳期、非备孕的情况下，还可以使用喹诺酮类的抗生素，比如氧氟沙星、左氧氟沙星、拜复乐(盐酸莫西沙星片)等。此外，无论是病毒还是细菌所致，都可用清热解毒、清咽利咽的中成药，比如三黄片、牛黄解毒片、蓝芩口服液、蒲地蓝消炎口服液、咽舒合剂等，都非常有效。