全飞秒治疗近视眼的副作用主要包括以下几种情况：1、眼睛干涩：全飞秒术后最常见的情况，若之前就存在眼睛较干的情况，术后眼睛干燥情况可能会更明显，一般术后1-3个月左右会慢慢缓解；2、眩光感：夜间光线较暗时，眼前会出现眩光感，每个人情况不同，部分人可能较轻微，也可能较明显，一般也在术后1-3个月可以逐渐缓解，甚至消退；3、角膜变薄、扩张：这种情况较严重也较少见，即角膜厚度不够情况下仍然进行激光近视矫正术，可能会出现后遗症状，角膜会因眼压波动而出现变薄、扩张，严重时候还需要进行角膜移植才能纠正这种状况。