普通肠镜检查一般20分钟内可完成，具体因人而异。部分患者做肠镜操作时，进镜非常顺利，2分钟能够到达回肠末段，肠镜检查可能10多分钟即可完成。退镜观察一般最少＞6分钟，需将整个结肠的黏膜观察到位。部分患者存在困难进镜，如做过腹部手术的人，可能存在肠粘连，还可由于肠道肿瘤，导致肠道牵扯，导致进镜较困难。这时需10多分钟，甚至20多分钟才可进入结肠的末段，这类肠镜检查时间较久。另外，需看肠镜下治疗的类型，如果肠镜下息肉较多，钳除或切除时间相对较长，需半小时，甚至更长时间。