男性小便时尿痛，常见于以下几种情况：1、淋菌性尿道炎：淋球菌破坏尿道黏膜，导致患者尿道黏膜红肿、糜烂，同时可出现水疱、脓疱，破裂后会形成黏膜糜烂面，引起排尿时尿痛症状，还伴有尿道口分泌物；2、非淋菌性尿道炎：如衣原体感染引起的尿道炎，导致尿道黏膜水肿、糜烂，使患者出现尿道黏膜破损，造成排尿时尿痛；3、后尿道结石：结石刺激后尿道时会引起尿痛，同时如果结石滑破尿道黏膜，患者会出现肉眼血尿。出现上述症状时，应及时到泌尿外科就医，通过规范的药物治疗，多数患者的症状会明显好转。如果患者反复出现上述症状，应规范药物治疗。