肾结石和肾囊肿的差别比较大，具体分析如下：1、症状不同：肾结石是肾脏内钙化导致，包括在泌尿系统内的结石形成，患者主要表现是肾绞痛，常出现患侧肾脏或者输尿管走行区域剧烈疼痛，有时患者还会伴有恶心、呕吐等消化道症状，严重者会出现尿频、尿急、尿痛，甚至血尿。肾囊肿没有典型或者特别显著的临床表现，即使囊肿可能已经长到5-6cm，但病人可能仍然没感觉，囊肿需要积极治疗。因为太大的囊肿可能会破裂、感染、诱发高血压；2、影像学检查表现不同：如果做泌尿系CT检查，可以清楚看到泌尿系的某个位置，如肾、输尿管、膀胱、尿道中看到结石，或者有多少个结石，以及结石大小，肾囊肿在B超、CT下可以得到明确诊断，但是看到的影像和结石截然不同。结石表现为亮白，如骨头样的图像，而囊肿如果没有特殊对照，是相对暗的液性区域。