小脑萎缩目前病因并不是较明确，比如变性病相关的小脑萎缩，比如多系统萎缩也可能会有小脑萎缩，小脑萎缩原因目前认为有以下情况：1、原发性少突胶质细胞变性形成α-突触核蛋白，少突胶质细胞导致神经脱髓鞘后，继而激活小胶质细胞，引起神经元变性和死亡；2、神经元本身α-突触核蛋白大量聚集导致神经元死亡；3、植物神经系统受累、锥体处受累。对于这类疾病没有特别好的治疗方法，目前这类变性疾病病因，仍然处于对疾病认识和探索的过程，没有特别确切的定论。