因为肠镜是从肛门检查肠道，大部分患者怀疑肠道大便较脏，检查结束后消毒是否干净。患者不用过于担心，肠镜消毒很干净。肠镜检查完之后，首先要用湿纱布擦去外表污物，再送到消毒间进行消毒。常规消毒过程有以下几步： 1、水洗：用流动水冲洗，反复冲洗镜身、附件和管道； 2、酶洗：冲洗干净之后进行酶洗，由于有很多酶液，需洗掉粘附的黏液，甚至血液组织； 3、清洗：用流动水再次反复清洗镜身、附件和管道，冲洗完之后用气枪充气，把管道内的水分排干净，以免稀释消毒液； 4、消毒灭菌：用消毒液，如常用戊二醛或者酸化水浸泡，根据消毒液的消毒效果不同，浸泡5分钟甚至20分钟、半小时； 5、冲洗：浸泡结束之后进行终末冲洗，用流动水反复再次冲洗镜身和管道。 所以肠镜消毒很彻底，不用过于担心。