化疗药物除杀伤肿瘤细胞之外，还对自身正常细胞有杀伤作用，因此患者常会有恶心、呕吐、腹泻、脱发、肝功能损害以及白细胞下降等毒副反应。多数毒副反应在患者停药后会消失，健康细胞恢复较快，消除副反应、重获活力的时间通常因人而异。 化疗对身体危害有多大具体取决于多种因素，包括患者的健康状况、免疫功能以及化疗药物副反应的偏重。有些化疗药物会引起严重消化道反应，有些化疗药物主要会抑制骨髓，导致患者出现白细胞、血小板减低，有些化疗药物会导致腹泻等相关症状。但目前在多学科共同努力下，化疗相关的副作用可得到较好控制，患者也较为安全。