按国家预防接种的程序，3个月的婴儿应该接种以下几种疫苗：1、脊髓灰质炎灭活疫苗：进行肌肉注射，脊髓灰质炎疫苗在婴儿2-3个月时可以接种，通常是接种在大腿部位；2、百白破疫苗：3个月进行第一针接种，之前脊髓灰质疫苗是糖丸，而不是针剂；3、五联疫苗：在3个月时通常是接种第二针，如果2个月时没接种，3个月可以接种五联疫苗第一针；4、13价肺炎疫苗：可以预防肺炎球菌引起的感染，如果家长经济条件较好，可以选择给婴儿接种13价肺炎疫苗。13价肺炎疫苗起始接种的年龄最小是8周，通常2-3个月开始接种；5、五价轮状疫苗：属于进口疫苗，通常2个月时可以接种第一针，3个月接种第二针。家长可以根据家庭条件，或者预防接种点门诊的情况，选择性接种。