通常短期应用制菌霉素，对于婴儿没有什么副作用。制菌霉素是一种抗真菌感染的抗菌素，临床上多用于治疗婴儿的鹅口疮。当婴儿有鹅口疮，即念珠菌感染时，可以应用制霉菌素涂抹于口腔，由于抗真菌作用非常好，所以通常2-3天鹅口疮能够得到非常有效的控制。因此制菌霉素对于婴儿来说，短时间的应用基本上没有明显的副作用，是非常安全的药物。但是如果长期、大量地使用制菌霉素，可能会对婴儿造成一些副作用，主要有以下几个方面：1、出现胃肠道的反应，比如恶心、呕吐、食欲的下降等；2、造成肠道菌群的紊乱。