头顶骨头凹陷的原因，主要包括以下几种：1、生理性因素：部分患者在先天发育过程中出现颅骨愈合不良或由于受到阻碍而形成颅骨局部凹陷，在生长过程中症状可能会愈发明显，但不会在短时间内发生明显变化；2、病理性因素：如感染引起颅骨骨髓炎，可能会造成颅骨局部破坏，即可导致颅骨凹陷。对于原发性颅骨骨髓瘤及继发性颅骨转移瘤的患者，由于肿瘤组织造成局部骨质的明显破坏而被软组织的肿瘤所替代，可以造成患者的颅顶局部凹陷，有时也会形成局部隆起且在触压时有质韧感，可能会引起局部疼痛。另外，颅骨嗜酸性肉芽肿也可以引起颅骨局部破坏，患者会出现明显压痛以及颅骨嗜酸性粒细胞增高。而患者存在颅骨脑膜静脉窦的情况下，在长期冲击下也会形成颅骨凹陷，触之局部柔软。