孩子扁桃体发炎以后后期出现咳嗽，并非是好转的情况，有些甚至因为扁桃体发炎继发出现支气管炎或支气管肺炎，后期也会伴有咳嗽，导致咳嗽的原因通常有以下几方面：1、疾病发展：咳嗽的症状并不是好转的指征，早期随着病症的发展过程，早期可能出现发热的情况，后期随着发热被炎症控制以后，可能会表现为咳嗽，可能是单纯的扁桃体发炎引起的咳嗽；2、继发感染：如果炎症尚未完全控制，出现下行感染，导致支气管炎或支气管肺炎，也会出现咳嗽的现象。这时除了及时进行止咳治疗以外，还要注意炎症状态是否完全控制。炎症并不是指单纯的发烧减退就一定存在炎症的缓解，如果扁桃体炎相对比较顽固，可能会出现反复发作或者伴有其它合并症的情况。如果后期出现咳嗽就好转，也有可能是病情加重的反应。如果出现上述情况，应该及时对症进行检查，明确诊断对症进行治疗，缓解疾病状态。