系膜增生性肾炎的治疗需要根据其他临床表现以及病理表现来制定，因为系膜增生性肾炎并不是单独的病理诊断。很多病理类型都可以表现为系膜增生，例如IgA肾病、膜性肾病、局灶节段硬化性肾病和膜增殖性肾病等。所以系膜增生性肾炎的治疗需要根据其他的表现来制定，如果表现比较轻，可以不采用免疫抑制剂，而是对症治疗。例如微小病变或者早期的膜性肾病，只需要应用血管紧张素转化酶抑制剂、血管紧张素受体拮抗剂，或者某些中成类的药物来进行治疗，如百令胶囊、肾炎康复片、金水宝等。如果伴有其他的病理类型，而且比较严重，例如3-4期的膜性肾病，或者尽管是1-2期的膜性肾病，但蛋白尿＞8g/24小时。或者膜性增生性肾病、局灶节段性硬化肾病，这个时候必须采用免疫抑制剂来进行治疗。单独应用1种免疫制剂可能效果不好，还需要加用第2种免疫制剂，同时采用血管紧张素转化酶抑制剂或者血管紧张素受体拮抗剂，以及某些刚才所说的中成类药物来共同治疗，才能达到治疗的目的。