巴氏腺囊肿治疗的方法有两种，保守治疗和手术治疗。巴氏腺位于大阴唇下方，特别容易受到病原菌侵入而发生感染。所以有时巴氏腺会发生急性的巴氏腺囊肿，甚至引起脓肿，病人会觉得疼痛难忍，还伴有发热等症状。此时的治疗，通常需要抗生素进行消炎。如果脓肿形成，通常需要做脓肿切开手术，具体如下：1、保守治疗：在平时，如果是巴氏腺囊肿，囊肿不太大，而且没有临床的症状。这种情况下，通常不需要治疗，仅观察、复查即可。2、手术治疗：如果巴氏腺囊肿较大，而且又有肿胀的症状，这个时候可以做手术。手术的方式也有两种，一个是巴腺囊肿剔除术，另外一个就是巴氏腺囊肿切开造口术。所以是否需要手术，以及如何治疗，病人还是应该到医院。在检查以后，听从医生的意见。