在新型冠状病毒核酸检测中，除进行咽部拭子检测外，亦可进行鼻拭子检测。对于某些疑似病例，为提高检测准确性，会同时采集这两个部位的样本。值得注意的是，鼻拭子检测的取样部位并非一般所理解的鼻孔部位，而是鼻腔深部。检测时会选用柔软的长棉签，该棉签可穿过鼻前庭、鼻甲并抵达咽腔上部，从顶区取样，这一过程可能相较咽拭子更为痛苦。在采样过程中，由于患者的鼻结构异常，如鼻中隔偏曲或鼻甲肥大，可能增加摩擦，导致疼痛、酸爽的感觉或者无法进入深处，则需换用另一鼻孔取样。由于鼻拭子取样可能较为痛苦，若能使用局部麻醉喷雾，或许能够缓解患者的不适，但并不便于普及，因为使用麻醉喷雾后可能需要稍等片刻方可取样。