试管婴儿第5天，即取卵手术后第5天出现腹痛的原因主要有以下几种：1、正常术后反应：若腹痛不严重可能是取卵手术后的正常反应，因双侧卵巢进行取卵手术后存在取卵针眼，针眼可能存在少量渗血或渗液，渗血和渗液进入盆腔后，对盆腔黏膜有刺激作用，较敏感的女性会出现腹痛。若只是轻微腹痛、持续时间较短且疼痛强度较弱，可能与取卵手术后的少量渗液有。或促排卵后虽已取卵，但双侧的卵巢比正常情况下体积增大，增大的卵巢浆膜张力高，可能受到炎症刺激，或张力大而造成疼痛；2、其他原因：胃肠道不适、阑尾炎症及盆腔炎症等也可能导致腹痛，若出现腹泻或胃肠道症状，需考虑胃肠疾病所引起的疼痛。具体哪种原因，还需根据自身情况及时与医生取得联系。